Game FOLD.IT - how gamers help in the fight against AIDS

Birçok insan bilgisayar oyunlarının topluma fayda sağlamayacağını düşünür, aksine zararı vardır. Prensip olarak, bu doğrudur, ancak herhangi bir kuralın istisnaları vardır. Örneğin, Foldit protein sentez emülatörü şu anda, şu anda tedavi edilemeyen hastalıkların tedavisi sorunlarının çözülmesine katkıda bulunabileceğiniz birkaç oyundan biridir.Vücudumuzda proteinlerin katılımı olmadan gerçekleşecek bir süreci hayal etmek zordur. Her bir hücrenin tabanında, virüslerin ve patojenik bakterilerin temeli de dahil olmak üzere bir protein vardır. Bir proteinin özellikleri şekil ve bağlarından etkilenir. Bu parametreler üzerinde hareket etmek zorundayız. Sonuç olarak, bir proteini kompakt bir forma katlarsanız, kompozisyonunun değişmemiş gibi görünse bile, artık işlevlerini yerine getiremeyecektir. Virüs proteinleri dahil, vücudumuza saldıramayacak.Bilim adamlarının görevi (ve kullanıcı oyunlarında), proteini mümkün olduğunca kompakt bir şekilde katlamaktır. Kazandığınız puanlardan ne kadar iyi yaptığınızı anlayacaksınız. Oyununuzun sonuçları, genel çevrimiçi sıralamaya katılacak ve bilim insanlarına kanser, AIDS ve diğer ölümcül ve henüz iyileştirilemeyen hastalıklar gibi hastalıkların tedavisinde yardımcı olacaktır.Fold.it adlı oyun projesinin ilk lansmanı, Washington Üniversitesi'ndeki bilim adamları sayesinde Mayıs 2008'de gerçekleşti. O zamandan beri 240.000'den fazla oyuncu kayıt edildi.Bilinen proteinlerin yapısını tahmin etmenin yanı sıra verilen hedeflere uygun olması gereken yenilerini yaratmanın yanı sıra, Foldit'in geliştiricileri de bu görevlerin otomatik olarak yürütülmesi için algoritmalar oluşturulmasına yardımcı olmalarını sağladı. Bu tür "tarifler", özel bir betik dilinde veya grafiksel bir arayüz kullanılarak oluşturulur. Her oyuncunun kendi "yemek kitabı" algoritmaları vardır. Oyuncular birbirleriyle "yemek tarifleri" paylaşabilir, diğer kullanıcıların algoritmalarını geliştirebilir ve birleştirebilir.Her görev, kullanıcıların birbirleriyle yarıştığı belirli bir süre boyunca sitede yayınlanmaktadır. Ayrıca, yeni kullanıcıları Foldit'in özellikleriyle tanıştırmak için tasarlanmış sürekli bir dizi bulmaca da var. Oyun sırasında, oyuncular etkileşimli olarak ana çerçevenin şeklini ve yan grupların konumunu değiştirerek molekülü manipüle ederler, aynı zamanda α-sarmallarını eksenleri etrafında döndürürler, β yapılarındaki zincirlerin mesajını değiştirebilir ve belirli alanlarda zayıf kısıtlamalar uygulayabilirler. Kullanıcı, noktaları şeklinde protein katlamayı ne kadar iyi yönettiğine dair bilgi alır.Uygulama, insan aklının kolektif düşüncesinin, en güçlü modern bilgisayarlardan çok daha verimli olduğunu göstermiştir.Yani 2011'de, oyuncular maymunlarda AIDS'e neden olan maymun virüsü kristali, retroviral proteazın (M-PMV) yapısını deşifre etmeye yardımcı olmuştur. Bulmaca sadece üç hafta boyunca oynanabilirdi, ancak kod çözme onuncu günde yapıldı ve problem 15 yıldır bilim adamlarını şaşırtmıştı.Ve Ocak 2012'de, Scientific American oyuncuları, Diels - Alder reaksiyonunda bir katalizör görevi gören proteinin yapısını değiştirmek için ilk projeyi tamamladılar ve kullanıcılar tarafından önerilen yeni yapı, bilim adamları tarafından hesaplanan orijinalden 18 kat daha aktif hale geldi. bilgisayar

Many people think that computer games do not bring any benefit to society, but on the contrary do harm. In principle, this is true, but any rule has its exceptions. For example, the Foldit protein synthesis emulator is currently one of the few games that you can play in which you can contribute to solving the problems of treating currently incurable diseases.It is difficult to imagine a process inside our body that would occur without the participation of proteins. At the base of each cell there is a protein, including the basis of viruses and pathogenic bacteria. The properties of a protein are affected by its shape and bonds. It is on these parameters that we will have to act. The bottom line is that if you fold a protein into a compact form, even though it seems that its composition has not changed, it will no longer be able to perform its functions. Including virus proteins, will not be able to attack our body.The task of scientists (and in the game of users) is to fold protein as compactly as possible. You will understand how well you do it from the number of points you earn. The results of your game will participate in the general online ranking and will be able to help scientists in treating such diseases like cancer, AIDS and many other deadly and not yet curable diseases.The first launch of the game project called Fold.it took place in May 2008, thanks to scientists at Washington University. Since then, more than 240,000 players have been registered.In addition to predicting the structure of known proteins and creating new ones that should be suitable for specified purposes, the developers of Foldit offered players help in creating algorithms for automated performance of these tasks. Such “recipes” are created either in a special scripting language or using a graphical interface. Each The player has his own "cookbook" with algorithms. Players can share "recipes" with each other, improve and combine the algorithms of other users.Each task is published on the site for a certain period during which users compete with each other. There is also a set of constantly available puzzles designed to familiarize new users with the features of “Foldit.” During the game, players interactively manipulate the molecule, changing the shape of the main frame and the position of the side frames. groups, they can also rotate α-helix around their axes, change the message of chains in β-structures, impose weak restrictions in certain areas. The user receives information ation of how well he is able to fold the protein in the form of points.Practice has shown that the collective thinking of the human mind is much more efficient than the most powerful modern computers. So in 2011, players helped decipher the structure of the monkey virus crystal, retroviral protease (M-PMV), which causes AIDS in monkeys. The puzzle was available for play for only three weeks, but the decoding was done on the tenth day, and the problem had puzzled scientists for 15 years.And in January 2012, Scientific American players completed the first project to change the structure of the protein that serves as a catalyst in the Diels – Alder reaction, and the new structure proposed by users turned out to be more than 18 times more active than the original, calculated by scientists for computer.

İmage1